Protein–RNA interactions for Protein: A2AK85

6330409D20Rik, RIKEN cDNA 6330409D20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6330409D20RikA2AK85 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
6330409D20RikA2AK85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
6330409D20RikA2AK85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
6330409D20RikA2AK85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
6330409D20RikA2AK85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms