Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel3A2AHA7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramel3A2AHA7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pramel3A2AHA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pramel3A2AHA7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms