Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930447F04RikA2AFR2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930447F04RikA2AFR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms