Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a3A2ACT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Col9a3A2ACT7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Col9a3A2ACT7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms