Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pramef6A2A8M8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef6A2A8M8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms