Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdr2lA2A6T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdr2lA2A6T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdr2lA2A6T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdr2lA2A6T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197 ms