Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc1lA2A5N3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc1lA2A5N3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pabpc1lA2A5N3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms