Protein–RNA interactions for Protein: A1A535

Veph1, Ventricular zone-expressed PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Veph1A1A535 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Veph1A1A535 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Veph1A1A535 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Veph1A1A535 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Veph1A1A535 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Veph1A1A535 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Veph1A1A535 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Veph1A1A535 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Veph1A1A535 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms