Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cc2d2bA0A286YDU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cc2d2bA0A286YDU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cc2d2bA0A286YDU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cc2d2bA0A286YDU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cc2d2bA0A286YDU8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms