Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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