Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms