Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms