Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.56■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700019A02RikA0A087WPV9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms