Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac6Q9Z2V5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hdac6Q9Z2V5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac6Q9Z2V5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms