Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka4Q9Z2B9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms