Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip6Q9Z1Y4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip6Q9Z1Y4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms