Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arid3bQ9Z1N7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arid3bQ9Z1N7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arid3bQ9Z1N7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arid3bQ9Z1N7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arid3bQ9Z1N7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arid3bQ9Z1N7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arid3bQ9Z1N7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms