Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Carm1Q9WVG6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Carm1Q9WVG6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms