Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nme3Q9WV85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nme3Q9WV85 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms