Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfsf13bQ9WU72 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf13bQ9WU72 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms