Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cry2Q9R194 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cry2Q9R194 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cry2Q9R194 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cry2Q9R194 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms