Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NrkQ9R0G8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NrkQ9R0G8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NrkQ9R0G8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
NrkQ9R0G8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NrkQ9R0G8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms