Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zeb2Q9R0G7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zeb2Q9R0G7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zeb2Q9R0G7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zeb2Q9R0G7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms