Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtsfQ9R013 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtsfQ9R013 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtsfQ9R013 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms