Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh2d3cQ9QZS8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh2d3cQ9QZS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh2d3cQ9QZS8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sh2d3cQ9QZS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sh2d3cQ9QZS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms