Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Six6Q9QZ28 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms