Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PnckQ9QYK9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PnckQ9QYK9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PnckQ9QYK9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PnckQ9QYK9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms