Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snai3Q9QY31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms