Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpc5Q9QX29 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpc5Q9QX29 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.7 ms