Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col5a3Q9JLI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col5a3Q9JLI2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col5a3Q9JLI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col5a3Q9JLI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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