Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx20Q9JJY4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx20Q9JJY4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx20Q9JJY4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx20Q9JJY4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms