Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Riox1Q9JJF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Riox1Q9JJF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms