Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sv2aQ9JIS5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sv2aQ9JIS5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms