Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc22Q9JIG7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc22Q9JIG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc22Q9JIG7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc22Q9JIG7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms