Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn19Q9ET38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms