Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dkc1Q9ESX5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dkc1Q9ESX5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dkc1Q9ESX5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms