Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OtofQ9ESF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OtofQ9ESF1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
OtofQ9ESF1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
OtofQ9ESF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms