Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc46a3Q9DC26 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc46a3Q9DC26 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc46a3Q9DC26 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms