Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cbx6Q9DBY5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx6Q9DBY5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms