Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf6Q9DBU5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf6Q9DBU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms