Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrpraQ9DBG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpraQ9DBG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrpraQ9DBG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrpraQ9DBG7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms