Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyp27a1Q9DBG1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cyp27a1Q9DBG1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp27a1Q9DBG1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms