Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med29Q9DB91 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med29Q9DB91 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med29Q9DB91 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms