Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rsph3bQ9DA80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rsph3bQ9DA80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rsph3bQ9DA80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rsph3bQ9DA80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms