Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sgf29Q9DA08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sgf29Q9DA08 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sgf29Q9DA08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms