Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bpifa3Q9D9J8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bpifa3Q9D9J8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bpifa3Q9D9J8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms