Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SlirpQ9D8T7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms