Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl4Q9D8E6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl4Q9D8E6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpl4Q9D8E6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpl4Q9D8E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms