Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AplfQ9D842 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AplfQ9D842 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AplfQ9D842 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AplfQ9D842 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms