Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fip1l1Q9D824 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fip1l1Q9D824 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fip1l1Q9D824 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms